1868 erhielt die Compagnie des Chemins de Fer Orientaux (CO), Orient Railway Company, die Konzession zum Bau einer Eisenbahn zwischen Wien, über Edirne nach Istanbul. Im Jahr 1871 erreichte die Linie Edirne.
Um aber den Bau einer Brücke über den Fluss Maritsa (griechisch Έβρος Evros) zu vermeiden, wurde der Bahnhof 1873 in Karaağaç gebaut. Nach dem türkischen Unabhängigkeitskrieg und der Unterzeichnung des Vertrags von Lausanne verlief die türkisch-griechische Grenze am Fluss Maritsa, mit Ausnahme des Abschnitts Karaağaç, der auf türkischem Territorium verblieb.
Die Strecke wurde noch bis 1971 von den griechischen Staatsbahnen (OSE) genutzt.
Später beute die türkischen Staatsbahnen (TCDD) eine neue Strecke von Pehlivanköy durch die Stadt Edirne bis zur bulgarischen Grenze.
Die OSE verlegte neue Gleise zwischen Marasia und Nea Vyssa um den Weg über türkisches Territorium zu vermeiden.
Dies führte 1971 zur Aufgabe des Bahnhofs.
Nach Sanierungsarbeiten wurde das Bahnhofsgebäude zur Fakultät der Schönen Künste der Universität Trakya in Edirne. Das 1998 eröffnete Denkmal- und Museumsdenkmal Vertrag von Lausanne befindet sich neben dem ehemaligen Bahnhof.